北京协和医学院创办于1917年，最早开启了我国八年制临床医学教育的先河，在我国医学教育领域具有特殊的地位和独特的社会影响力，是卫生部唯一直属高校，与中国医学科学院实行院校合一的管理体制。2006年9月，根据教育部、卫生部签署的清华大学与我校紧密合作办学协议，以及两校关于落实两部协议的实施意见，“中国协和医科大学”更名为“北京协和医学院(清华大学医学部)”，清华大学雄厚的基础学科综合优势和优良的学术氛围，与协和在医学领域中强大的科学研究和临床医学实力，将优势互补，共同发展。

　　协和一贯坚持“小规模、高层次、高质量”的教育宗旨，有着“严谨、博精、创新、奉献”的优良校风。她不仅造就了张孝骞、林巧稚、黄家驷、吴阶平等中国医学界泰斗，还为我国医学事业培养了一大批享誉国内外的著名临床医学家、医学科学家、医学教育家。八年制临床医学专业一直坚持医学预科和医学本科分段教学、导师制等独特的培养模式，其因材施教、精雕细刻的教育特色在我国医学教育体系中独树一帜。
　　协和建有18个研究所，260多个实验室，其中国家级重点实验室4个，部委级重点实验室10个。

　　协和有三宝：名教授、图书馆、病案室。

　　名教授被誉为“协和三宝”之一，现有中国科学院院士9人、中国工程院院士16人(其中1人为两院院士)，长江学者特聘教授13人，讲座教授1人，             省部级以上突出贡献专家89人。学院共有博士生导师394人，硕士生导师654人。雄厚的师资为培养高质量的人才创造了有利的条件。

　　协和医学院的图书馆是我国历史悠久，藏书最为丰富的医学专业图书馆，是国务院批准的国家级中心图书馆和国家科技图书文献中心医学分中心，也是联合国世界卫生组织卫生与生物医学信息合作中心，藏书以生物医学书刊为主，总量超过50万册。
　　协和的病案室保存有孙中山、梁启超、张学良、宋美龄等名人的材料。目前保存病案近220万册，对疾病治疗和科研起到了极其重要的作用。
　　协和十分重视国际学术交流和科技合作，目前已与数十个国家(地区)的医学院校和科研机构建立合作关系，成立了10个世界卫生组织合作中心，并已成为国际生物医学研究高层组织(HIROs)成员单位。协和已授予200余名国外专家、学者为协和医学院的名誉教授或客座教授。自1985年以来，协和医学院相继与美国哈佛大学医学院、美国加州大学旧金山分校、香港中文大学医学院等学校签订了校际交流的协议，互相交换高年级学生到对方学校进行短期临床学习，以开阔学生的思维，丰富学生的见闻，提高学生的外语水平。